DNA extraction from frozen fieldcollected and dehydrated herbarium fungal basidiomata: performance of SDS and CTAB-based methods

Resumo

Extração de DNA de basidiomas congelados e de Herbário, através dos métodos SDS e CTAB. A extração deDNA de basidomas coletados e congelados e de espécimes de herbário coletados em diferentes períodos e mantidos de diferentes formas foi avaliada de acordo a condição geral, cor, razão de absorvância espectral, concentração final e amplificação PCR, utilizando dois dos métodos mais comuns de extração SDS (Sodium Doecyl Sulphate) e CTAB (Cetyl Trimetyl Ammonium Bromide). A maioria dos basidiomas congelados apresentou uma condição de DNA boa a muito boa e sem degradação. Todos os espécimes de herbário exibiram DNA em má condição com bandas de baixo peso molecular. Praticamente todas soluções de DNA das amostras foram coloridas e as taxas de absorbância foram consideravelmente variáveis, com valores menores nas zonas escuras. Todas as amostras foram amplificadas em PCR com sucesso. A extração de DNA de espécimes com alto conteúdo de polisacarídeos e de espécimes de herbário foram obtidas unicamente pelo método CTAB. Para uma proposta geral de extração de DNA de basidiomas coriáceos e lenhosos recém coletados e desidratados, com alto conteúdo de metabólitos secundários e/ou polissacarídeos, o método CTAB é a melhor escolha.