Predizendo os efeitos do polimorfismo de nucleotídeo único A122V sobre o receptor de quimiocina CXC do tipo 1 de bovino Bos taurus (Artiodactyla: Bovidae) por análises in silico

Autores

  • Anete Ferraz Guzzi Universidade Federal do Vale do São Francisco UNIVASF
  • Felipe Santos de Luna Oliveira Universidade Federal do Vale do São Francisco UNIVASF
  • Márcia Maria de Souza Amaro Universidade Federal do Vale do São Francisco UNIVASF
  • Paulo Fernando Tavares Filho Universidade Federal do Vale do São Francisco UNIVASF
  • Jane Eyre Gabriel Universidade Federal do Vale do São Francisco UNIVASF

DOI:

https://doi.org/10.5007/2175-7925.2017v30n4p1

Resumo

Este estudo objetivou predizer bioquimicamente as estruturas primárias e secundárias da proteína receptora de quimiocina CXCR1 bovina não polimórfica e polimórfica carreando o polimorfismo A122V por análises in silico. Duas sequências da proteína CXCR1 de bovino Bos taurus foram selecionadas a partir da base de dados de sequências de proteínas UniProtKB/Swiss-Prot: a) uma sequência não polimórfica (A7KWG0), contendo o aminoácido alanina (A) na posição 122, e b) uma sequência polimórfica, apresentando o aminoácido valina (V) na mesma posição. As estruturas primárias e secundárias da proteína foram preditas empregando os programas ProtParam e Chou & Fasman Protein Secondary Structure Prediction CFSSP. Diferenças nos parâmetros físicos e químicos não foram previstas a partir da estrutura primária de ambas as proteínas analisadas. A presença de um domínio helicoidal, situado nas posições 100 e 150, foi exclusivamente encontrada na proteína CXCR1 não polimórfica. Resíduos de aminoácidos de propriedades bioquímicas variáveis foram detectados na posição 122 na proteína CXCR1 dos ruminantes e humana, sugerindo que esse peptídeo é altamente polimórfico em vertebrados. Os resultados aqui descritos predizem diferenças no padrão da estrutura secundária da proteína CXCR1 bovina não polimórfica e polimórfica A122V empregando ferramentas de Bioinformática.

 

Biografia do Autor

Anete Ferraz Guzzi, Universidade Federal do Vale do São Francisco UNIVASF

Colegiado de Pós-Graduação em Ciências Veterinárias no Semiárido, Campus de Ciências Agrárias, Universidade Federal do Vale do São Francisco, CEP 56.300-000, Petrolina – PE, Brasil

Felipe Santos de Luna Oliveira, Universidade Federal do Vale do São Francisco UNIVASF

Colegiado Acadêmico de Ciências Biológicas, Campus de Ciências Agrárias, Universidade Federal do Vale do São Francisco, CEP 56.300-000, Petrolina – PE, Brasil

Márcia Maria de Souza Amaro, Universidade Federal do Vale do São Francisco UNIVASF

Colegiado Acadêmico de Ciências Biológicas, Campus de Ciências Agrárias, Universidade Federal do Vale do São Francisco, CEP 56.300-000, Petrolina – PE, Brasil

Paulo Fernando Tavares Filho, Universidade Federal do Vale do São Francisco UNIVASF

Colegiado Acadêmico de Engenharia da Computação, Campus de Juazeiro, Universidade Federal do Vale do São Francisco, CEP 48902-300, Juazeiro – BA, Brasil

Jane Eyre Gabriel, Universidade Federal do Vale do São Francisco UNIVASF

Graduação em Ciências Biológicas pelo Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas (1989), mestrado em Zootecnia pela Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho (1996) e doutorado em Ciências (Energia Nuclear na Agricultura) pela Universidade de São Paulo (2001). Atualmente, atua como Professora Adjunta III da Universidade Federal do Vale do São Francisco UNIVASF (Centro de Ciências Agrárias, Petrolina, PE). Tem experiência na área de Biologia Molecular Animal, Bioinformática, atuando principalmente nos seguintes temas: expressão gênica animal, genômica e proteômica, histologia geral.

 

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Publicado

2017-12-08

Edição

v. 30 n. 4 (2017)

Seção

Artigos

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