Terminologia de Interface: processamento de linguagem natural de dados clínicos em narrativas do Prontuário Eletrônico do Paciente

Autores/as

DOI:

https://doi.org/10.5007/1518-2924.2024.e94983

Palabras clave:

Registros Eletrônicos de Saúde, Dados de Saúde Gerados pelo Paciente, Recuperação da informação, Ginecologia, Processamento de linguagem Natural

Resumen

Objetivo: Apresentar a recuperação e análise de dados clínicos provenientes de anamnese de Prontuário Eletrônico de Pacientes (PEP), denominada nesta pesquisa como Terminologia de Interface

Método: O processo de coleta de dados clínicos desta pesquisa foi realizado em prontuários eletrônicos de pacientes de hospital privado.  A amostra dos dados foi composta por 18.256 anamneses do domínio da ginecologia do ano de 2018. Os dados clínicos foram recuperados por meio de Processamento de Linguagem Natural utilizando a linguagem Python. Foram analisados os termos mais frequentes relacionados aos dados clínicos do tipo: abreviaturas e siglas, stop words, procedimento e n-gramas.

Resultados:  Os dados clínicos têm potencial de reutilização para produção científica, traçar perfil epidemiológico e na criação de dicionários e enriquecimento de vocabulários controlados para o PEP e outros sistemas de informação em saúde. Além disso são importantes na delimitação de algoritmos para fins de recuperação da informação. Como resultados um repositório foi criado no OSF contendo planilhas e tabelas com os dados clínicos para seu reuso na delimitação de algoritmo, criações de nuvem de palavras e para identificar os termos mais frequentes em prontuários eletrônicos do paciente no domínio da Ginecologia, já os algoritmos utilizados na recuperação ad informação foram disponibilizados no GitHub. Os dados foram publicados no repositório OSF: https://osf.io/de43a/.

Conclusões: Os dados clínicos são informações sobre o paciente, utilizadas para fins de assistência, questões administrativas hospitalares, pesquisa relacionada à saúde e à doença do paciente. A Terminologia de Interface, exemplificada no PEP dos Hospital da pesquisa, apresentou diversidade de dados clínicos nas anamneses.

Descargas

Los datos de descargas todavía no están disponibles.

Biografía del autor/a

Amanda Damasceno de Souza, Universidad Federal de Minas Gerais

Profesor del Programa de Postgrado en Sistemas de Información y Gestión del Conocimiento (PPGSIGC) de la Universidad FUMEC. Doctorado en Gestión y Organización del Conocimiento por el PPG-GOC de la Universidad Federal de Minas Gerais (UFMG) (2021). Maestría en Ciencias de la Información por la Facultad de Ciencias de la Información de la Universidad Federal de Minas Gerais (ECI/UFMG) (2016). Especialista en Gestión de Información Estratégica por ECI/UFMG (2013). Licenciado en Biblioteconomía por la Universidad Federal de Minas Gerais (ECI/UFMG) (2005). Es miembro del Grupo de Investigación Centro de Estudios e Investigaciones sobre Recursos, Servicios y Praxis de la Información (NERSI). Miembro del grupo de investigación Representación del Conocimiento, Ontologías y Lenguaje (ReCOL). Miembro del Comité ABNT CE 021:002.032 Miembro del Comité de Ética en Investigación del Hospital Felício Rocho (Desde 2016). Coordinador Adjunto del Comité de Ética en Investigación del Hospital Felício Rocho (desde 2020). Participa como Profesora del Curso de Especialización en Estrategia de Atención en Enfermería-CEECE/UFMG, en las áreas de Enfermería en Cardiología y Hemodinámica y Gestión de la Calidad en Salud y Enfermería.

Frederico Giffoni de Carvalho Dutra, Universidad FUMEC

Profesor, investigador, Doctor en Gestión de la Información y el Conocimiento por la Universidad Federal de Minas Gerais (2020), Máster en Gestión de la Información y el Conocimiento por la Universidad Federal de Minas Gerais (2014), Especialista en Gestión de Marketing Estratégico (2007) y Licenciado en Administración (2005). Actúa en el área de Comunicación, Marketing e Inteligencia de la Companhia Energética de Minas Gerais - CEMIG, con foco en inteligencia y seguimiento de clientes y marcas en redes sociales e imparte cursos de pregrado y posgrado.

Fábio Corrêa, Universidad FUMEC

Postdoctorado del Programa de Ciencias de la Información de la Universidad Federal de Minas Gerais (UFMG). Doctor y Máster en Sistemas de Información y Gestión del Conocimiento. Tiene un MBA en Ingeniería de Software y Gobernanza de Tecnologías de la Información y una licenciatura en Sistemas de Información. Actuando como Profesor de la Carrera de Informática y del Programa de Posgrado en Sistemas de Información y Gestión del Conocimiento de la Universidad FUMEC. Experiencia profesional en consultoría y Proyectos de Investigación y Desarrollo, además de trabajar durante 15 años en el mercado de Tecnologías de la Información. Actualmente es profesor del Programa de Pregrado y Posgrado en Sistemas de Información y Gestión del Conocimiento de la Universidad FUMEC. Se desempeña en el área de Ciencias de la Computación, con énfasis en Sistemas de Información, y Ciencias de la Información, con énfasis en Gestión del Conocimiento.

Helton Júnio da Silva, Universidad FUMEC

Abogado, Gestor de Activos, Profesor Universitario en los cursos de Postgrado en Derecho Inmobiliario y Derecho Notarial y Registral de la Pontificia Universidad Católica de Minas Gerais, estudiante de Doctorado en Sistemas de Información y Gestión del Conocimiento, Maestría en Derecho Privado de la Universidad FUMEC - Fundação Mineira de Educación y Cultura (2018), Postgrado en Derecho Notarial y Registral por la Facultad Milton Campos (2016), Postgrado en Asesoría Jurídica Empresarial por el Centro Universitário UNISEB (2011), Postgrado en Derecho Público por la Universidade Cândido Mendes (2009), Licenciado en Derecho por la Pontificia Universidad Católica de Minas Gerais (2008), Licenciada en Pedagogía por la Universidad Estadual de Minas Gerais (2003). Se desempeñó como Pedagogo y Gerente Escolar en la Administración Pública y en el sector educativo privado. Actualmente es Asset Manager en ArcelorMittal Brasil trabajando en los procesos Real Estate de empresas del grupo ArcelorMittal en Brasil.

Jurema Suely de Araújo Nery Ribeiro, Universidad FUMEC

Doctorado en Sistemas de Información y Gestión del Conocimiento - FUMEC (2019). Maestría en Administración - Área de investigación: Estrategia y Competitividad - de la Facultad de Estudios Administrativos de Minas Gerias - FEAD (2008); MBA en Logística por el Centro Universitario de Ciencias de la Gestión - UNA (2004); MBA en Finanzas por el Centro Universitario de Ciencias de la Gestión - UNA (2004); MBA en Gestión Institucional por el Centro de Posgrado Pitágoras (2011), Especialización en Administración de la Producción por el Instituto de Educación Tecnológica - IETEC (1997); Licenciado en Administración por el Centro Universitario Newton Paiva (1991).

Eduardo Ribeiro Felipe, Instituto de Ciencias Tecnológicas

Profesor adjunto de la Universidad Federal de Itajubá, tiene doctorado en Gestión y Organización del Conocimiento, maestría en Ciencias de la Información por la UFMG. Es Tecnólogo en Procesamiento de Datos del Centro Universitário Newton Paiva y posgrado en Ingeniería de Software de la PUC-Minas. Trabaja en las áreas de Lenguajes de Programación, Desarrollo Web, Recuperación de Información y Ontologías.

Citas

BAUD, R.H.; et al. Reconciliation of ontology and terminology to cope with linguistics. Studies in Health Technology and Informatics, Amsterdam, v.129, Pt 1, p.796-801, 2007.

BIRD, S.; KLEIN, E.; LOPER, E. Natural Language Processing with Python: Analyzing Text with the Natural Language Toolkit. Sebastopol: O'Reilly Media, 2019. Disponível em: http://www.nltk.org/book/. Acesso em 15 fev 2021.

BLOBEL, B. Interoperable EHR Systems – Challenges, Standards and Solutions. European Journal for Biomedical Informatics, Praga, v.14, n,2, p.10-19, 2018.

BRASIL. Resolução CFM nº 2056 de 20 de setembro de 2013. Disciplina os departamentos de Fiscalização nos Conselhos Regionais de Medicina, estabelece critérios para a autorização de funcionamento dos serviços médicos de quaisquer naturezas, bem como estabelece critérios mínimos para seu funcionamento, vedando o funcionamento daqueles que não estejam de acordo com os mesmos. Trata também dos roteiros de anamnese a serem adotados em todo o Brasil, inclusive nos estabelecimentos de ensino médico, bem como os roteiros para perícias médicas e a organização do prontuário de pacientes assistidos em ambientes de trabalho dos médicos.Brasília, DF: Presidência da República, 2013. Disponível em : https://www.legisweb.com.br/legislacao/?id=261676. Acesso em 07 jan.2020.

CONSELHO FEDERAL DE MEDICINA. Código de Ética Médica. Resolução CFM nº 1.931, de 17 de setembro de 2009.Brasília: CFM, 2010. (versão de bolso). Disponível em : https://portal.cfm.org.br/images/stories/biblioteca/codigo%20de%20etica%20medica.pdf. Acesso 07 jan. 2020.

CONSELHO REGIONAL DE MEDICINA DO DISTRITO FEDERAL. Prontuário médico do paciente: guia para uso prático. Brasília: Conselho Regional de Medicina, 2006. Disponível em : http://www.crmdf.org.br/sistemas/biblioteca/files/7.pdf. Acesso 09 ago 2012.

DALIANIS, H. Characteristics of Patient Records and Clinical Corpora. In: DALIANIS, H. Clinical Text Mining: Secondary Use of Electronic Patient Records. [s.n.],2018. cap. 4 Disponível em:http://link.springer.com/10.1007/978-3-319-78503-5. Acesso em: 2 jan. 2019.

FARLEX PARTNER MEDICAL DICTIONARY. Anamnesis. 2012. Disponível em: https://medical-dictionary.thefreedictionary.com/anamnesis. Acesso em: 7 jan 2020.

GRÜNE, S. Anamnese und körperliche Untersuchung. Deutsche Medicinische Wochenschrift, Stuttgart, v.141, n.1, p.24-7. Jan. 2016.

LÓPEZ, M. Anamnese. In: LÓPEZ, M.; MEDEIROS, J.L. Semiologia Médica: as bases do diagnóstico clínico. 3.ed. Atheneu: Rio de Janeiro, 1990. Cap. 2, p. 20-34.

MANNING, C. D.; SCHÜTZE, H. Foundations of statistical natural language processing. Cambridge Massachusetts: MIT press, 1999. 620 p.

MOSLEY, M. (ed.). et al. The DAMA Guide to the Data Management Body of knowledge (DAMA- DMBOK Book). Bradley Beach, NJ: Technics Publications, 2009. 406p.

SCHULZ, S.; et al. Interface Terminologies, Reference Terminologies and Aggregation Terminologies: A Strategy for Better Integration. Studies in Health Technology and Informatics, Amsterdam, v. 245, p. 940-944. 2017.

SHORTLIFFE, E.H.; BARNETT, G.O. Biomedical Data: Their Acquisition, Storage, and Use. In: SHORTLIFFE, E.H.; CIMINO, J.J. (Editors). Biomedical Informatics: Computer Applications in Health Care and Biomedicine. 4th Ed. London: Springer-Verlag, 2014. Cap.2, p.46-79.

SOUZA, A. D. INTERFACE TERMINOLOGY: INTERFACE TERMINOLOGY: Natural language processing of clinical data in Electronic Health Record narratives. OSF [dataset], 2023. Disponível em: https://osf.io/de43a/.Acesso em 06 jun 2023.

SOUZA, A.D. O discurso na prática clínica e as terminologias de padronização: investigando a conexão. 2021. Tese (Doutorado em Gestão e Organização do Conhecimento). Pós-Graduação em Gestão e Organização do Conhecimento, Escola de Ciência da Informação, Universidade Federal de Minas Gerais, Belo Horizonte, 2021.Disponível em: http://hdl.handle.net/1843/38044. Acesso em 06 jun. 2023.

WANG Z, et al. Extracting diagnoses and investigation results from unstructured text in electronic health records by semi-supervised machine learning. PLoS One, San Francisco, v.7, n.1, p.e30412, 2012.

Publicado

2024-03-02

Cómo citar

SOUZA, Amanda Damasceno de; DUTRA, Frederico Giffoni de Carvalho; CORRÊA, Fábio; SILVA, Helton Júnio da; RIBEIRO, Jurema Suely de Araújo Nery; FELIPE, Eduardo Ribeiro. Terminologia de Interface: processamento de linguagem natural de dados clínicos em narrativas do Prontuário Eletrônico do Paciente. Encontros Bibli: revista electrónica de bibliotecología y ciencias de la información., [S. l.], v. 29, p. 01–13, 2024. DOI: 10.5007/1518-2924.2024.e94983. Disponível em: https://periodicos.ufsc.br/index.php/eb/article/view/94983. Acesso em: 30 nov. 2024.